Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP40Q5TG30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP40Q5TG30 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP40Q5TG30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGAP40Q5TG30 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGAP40Q5TG30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGAP40Q5TG30 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms