Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMG4Q5JS54 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMG4Q5JS54 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMG4Q5JS54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMG4Q5JS54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMG4Q5JS54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMG4Q5JS54 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMG4Q5JS54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMG4Q5JS54 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMG4Q5JS54 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms