Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIPR1Q53HC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIPR1Q53HC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIPR1Q53HC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIPR1Q53HC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIPR1Q53HC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIPR1Q53HC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIPR1Q53HC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIPR1Q53HC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms