Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC23Q53EV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC23Q53EV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC23Q53EV4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC23Q53EV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC23Q53EV4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC23Q53EV4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC23Q53EV4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms