Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT71Q3SY84 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT71Q3SY84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT71Q3SY84 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT71Q3SY84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT71Q3SY84 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT71Q3SY84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT71Q3SY84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT71Q3SY84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms