Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLA2G4EQ3MJ16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4EQ3MJ16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4EQ3MJ16 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4EQ3MJ16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLA2G4EQ3MJ16 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLA2G4EQ3MJ16 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLA2G4EQ3MJ16 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLA2G4EQ3MJ16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4EQ3MJ16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4EQ3MJ16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G4EQ3MJ16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G4EQ3MJ16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G4EQ3MJ16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4EQ3MJ16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLA2G4EQ3MJ16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms