Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM21Q3B7S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM21Q3B7S5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM21Q3B7S5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM21Q3B7S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM21Q3B7S5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms