Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAM9

TUSC1, Tumor suppressor candidate gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC1Q2TAM9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUSC1Q2TAM9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUSC1Q2TAM9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUSC1Q2TAM9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUSC1Q2TAM9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUSC1Q2TAM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUSC1Q2TAM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms