Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROSER3Q2NL68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PROSER3Q2NL68 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PROSER3Q2NL68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PROSER3Q2NL68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PROSER3Q2NL68 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PROSER3Q2NL68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PROSER3Q2NL68 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PROSER3Q2NL68 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PROSER3Q2NL68 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PROSER3Q2NL68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PROSER3Q2NL68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROSER3Q2NL68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PROSER3Q2NL68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PROSER3Q2NL68 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms