Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN21Q16825 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN21Q16825 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN21Q16825 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN21Q16825 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPN21Q16825 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPN21Q16825 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN21Q16825 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN21Q16825 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN21Q16825 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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