Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TTC31-204ENST00000424122 2806 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.591e-16■■■■■ 80.1
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SF3B4Q15427 TTC31-213ENST00000491252 3860 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-212ENST00000489152 4025 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-16■■■■■ 80.1
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SF3B4Q15427 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.819e-11■■■■■ 79.4
SF3B4Q15427 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.441e-10■■■■■ 79.4
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SF3B4Q15427 LRP1-206ENST00000554118 418 ntTSL 26.94□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 78.7
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SF3B4Q15427 MYBBP1A-213ENST00000575662 687 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-18■■■■■ 78.6
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SF3B4Q15427 IST1-209ENST00000536027 823 ntTSL 33.46□□□□□ -1.861e-24■■■■■ 77.5
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SF3B4Q15427 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 75.8
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SF3B4Q15427 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 37.36□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 73.7
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SF3B4Q15427 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 26.02□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 73.7
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SF3B4Q15427 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-22■■■■■ 73.5
SF3B4Q15427 SLC39A14-205ENST00000517370 839 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-22■■■■■ 73.5
SF3B4Q15427 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-22■■■■■ 73.5
SF3B4Q15427 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-22■■■■■ 73.5
SF3B4Q15427 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.682e-22■■■■■ 73.5
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SF3B4Q15427 RPL34-205ENST00000503574 2627 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-22■■■■■ 73.5
SF3B4Q15427 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.292e-22■■■■■ 73.5
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