Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBBP5Q15291 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RBBP5Q15291 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP5Q15291 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP5Q15291 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP5Q15291 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP5Q15291 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBBP5Q15291 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP5Q15291 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms