Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2BQ14289 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTK2BQ14289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTK2BQ14289 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTK2BQ14289 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTK2BQ14289 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTK2BQ14289 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2BQ14289 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2BQ14289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2BQ14289 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK2BQ14289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2BQ14289 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms