Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBA3CQ13748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA3CQ13748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3CQ13748 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3CQ13748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3CQ13748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA3CQ13748 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA3CQ13748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms