Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAMK2BQ13554 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAMK2BQ13554 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAMK2BQ13554 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMK2BQ13554 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAMK2BQ13554 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMK2BQ13554 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAMK2BQ13554 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAMK2BQ13554 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMK2BQ13554 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMK2BQ13554 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMK2BQ13554 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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