Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SP140Q13342 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP140Q13342 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP140Q13342 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP140Q13342 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP140Q13342 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP140Q13342 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP140Q13342 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP140Q13342 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP140Q13342 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP140Q13342 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SP140Q13342 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP140Q13342 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP140Q13342 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP140Q13342 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SP140Q13342 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP140Q13342 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP140Q13342 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP140Q13342 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP140Q13342 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP140Q13342 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP140Q13342 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SP140Q13342 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP140Q13342 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP140Q13342 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP140Q13342 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP140Q13342 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP140Q13342 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP140Q13342 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP140Q13342 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP140Q13342 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP140Q13342 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP140Q13342 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP140Q13342 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP140Q13342 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP140Q13342 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP140Q13342 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP140Q13342 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP140Q13342 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP140Q13342 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP140Q13342 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP140Q13342 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP140Q13342 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP140Q13342 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP140Q13342 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP140Q13342 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP140Q13342 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP140Q13342 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SP140Q13342 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP140Q13342 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP140Q13342 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP140Q13342 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP140Q13342 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP140Q13342 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP140Q13342 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP140Q13342 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SP140Q13342 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP140Q13342 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP140Q13342 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP140Q13342 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP140Q13342 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP140Q13342 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP140Q13342 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SP140Q13342 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP140Q13342 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP140Q13342 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP140Q13342 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP140Q13342 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP140Q13342 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP140Q13342 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP140Q13342 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP140Q13342 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP140Q13342 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP140Q13342 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP140Q13342 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP140Q13342 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SP140Q13342 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP140Q13342 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP140Q13342 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP140Q13342 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP140Q13342 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP140Q13342 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP140Q13342 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP140Q13342 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP140Q13342 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP140Q13342 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP140Q13342 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP140Q13342 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP140Q13342 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP140Q13342 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SP140Q13342 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP140Q13342 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP140Q13342 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP140Q13342 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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