Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PAPPAQ13219 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PAPPAQ13219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PAPPAQ13219 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PAPPAQ13219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PAPPAQ13219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PAPPAQ13219 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PAPPAQ13219 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PAPPAQ13219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PAPPAQ13219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PAPPAQ13219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PAPPAQ13219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PAPPAQ13219 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PAPPAQ13219 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PAPPAQ13219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PAPPAQ13219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PAPPAQ13219 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PAPPAQ13219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PAPPAQ13219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PAPPAQ13219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PAPPAQ13219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PAPPAQ13219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
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