Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MKRN3Q13064 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MKRN3Q13064 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MKRN3Q13064 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MKRN3Q13064 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MKRN3Q13064 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
MKRN3Q13064 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MKRN3Q13064 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MKRN3Q13064 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
MKRN3Q13064 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MKRN3Q13064 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
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