Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
MKRN3Q13064 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
MKRN3Q13064 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
MKRN3Q13064 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
MKRN3Q13064 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MKRN3Q13064 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
MKRN3Q13064 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MKRN3Q13064 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MKRN3Q13064 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MKRN3Q13064 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
MKRN3Q13064 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
MKRN3Q13064 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
MKRN3Q13064 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MKRN3Q13064 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MKRN3Q13064 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MKRN3Q13064 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MKRN3Q13064 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MKRN3Q13064 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MKRN3Q13064 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MKRN3Q13064 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MKRN3Q13064 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MKRN3Q13064 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MKRN3Q13064 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MKRN3Q13064 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MKRN3Q13064 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MKRN3Q13064 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MKRN3Q13064 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MKRN3Q13064 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MKRN3Q13064 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
MKRN3Q13064 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MKRN3Q13064 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MKRN3Q13064 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
MKRN3Q13064 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MKRN3Q13064 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MKRN3Q13064 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MKRN3Q13064 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
MKRN3Q13064 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
MKRN3Q13064 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MKRN3Q13064 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MKRN3Q13064 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MKRN3Q13064 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MKRN3Q13064 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MKRN3Q13064 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
MKRN3Q13064 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MKRN3Q13064 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MKRN3Q13064 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MKRN3Q13064 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MKRN3Q13064 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MKRN3Q13064 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MKRN3Q13064 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MKRN3Q13064 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MKRN3Q13064 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MKRN3Q13064 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MKRN3Q13064 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MKRN3Q13064 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MKRN3Q13064 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MKRN3Q13064 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MKRN3Q13064 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MKRN3Q13064 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MKRN3Q13064 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MKRN3Q13064 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MKRN3Q13064 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MKRN3Q13064 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MKRN3Q13064 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MKRN3Q13064 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MKRN3Q13064 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MKRN3Q13064 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MKRN3Q13064 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MKRN3Q13064 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MKRN3Q13064 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
MKRN3Q13064 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MKRN3Q13064 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MKRN3Q13064 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MKRN3Q13064 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MKRN3Q13064 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MKRN3Q13064 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MKRN3Q13064 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MKRN3Q13064 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MKRN3Q13064 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MKRN3Q13064 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MKRN3Q13064 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MKRN3Q13064 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MKRN3Q13064 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MKRN3Q13064 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MKRN3Q13064 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MKRN3Q13064 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MKRN3Q13064 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MKRN3Q13064 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MKRN3Q13064 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
MKRN3Q13064 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MKRN3Q13064 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MKRN3Q13064 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MKRN3Q13064 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MKRN3Q13064 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MKRN3Q13064 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MKRN3Q13064 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MKRN3Q13064 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MKRN3Q13064 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MKRN3Q13064 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MKRN3Q13064 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
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