Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BNIP1Q12981 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP1Q12981 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP1Q12981 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP1Q12981 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNIP1Q12981 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNIP1Q12981 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNIP1Q12981 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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