Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE4BQ07343 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PDE4BQ07343 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE4BQ07343 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE4BQ07343 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDE4BQ07343 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE4BQ07343 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE4BQ07343 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE4BQ07343 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE4BQ07343 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE4BQ07343 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE4BQ07343 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE4BQ07343 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE4BQ07343 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE4BQ07343 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE4BQ07343 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE4BQ07343 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE4BQ07343 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms