Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RELQ04864 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RELQ04864 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELQ04864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELQ04864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELQ04864 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELQ04864 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELQ04864 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELQ04864 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELQ04864 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELQ04864 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELQ04864 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELQ04864 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELQ04864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELQ04864 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RELQ04864 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELQ04864 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELQ04864 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELQ04864 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELQ04864 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELQ04864 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELQ04864 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELQ04864 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELQ04864 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELQ04864 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELQ04864 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELQ04864 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELQ04864 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELQ04864 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELQ04864 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELQ04864 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELQ04864 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELQ04864 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELQ04864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RELQ04864 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RELQ04864 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RELQ04864 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RELQ04864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RELQ04864 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELQ04864 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELQ04864 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RELQ04864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RELQ04864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RELQ04864 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELQ04864 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELQ04864 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELQ04864 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELQ04864 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELQ04864 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELQ04864 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELQ04864 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELQ04864 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELQ04864 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELQ04864 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELQ04864 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELQ04864 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELQ04864 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELQ04864 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELQ04864 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELQ04864 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELQ04864 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELQ04864 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELQ04864 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELQ04864 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELQ04864 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELQ04864 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RELQ04864 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELQ04864 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELQ04864 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RELQ04864 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RELQ04864 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RELQ04864 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RELQ04864 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RELQ04864 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RELQ04864 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RELQ04864 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RELQ04864 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RELQ04864 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RELQ04864 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RELQ04864 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RELQ04864 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RELQ04864 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELQ04864 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RELQ04864 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELQ04864 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELQ04864 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELQ04864 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELQ04864 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELQ04864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELQ04864 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms