Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR1P84550 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKOR1P84550 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SKOR1P84550 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKOR1P84550 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKOR1P84550 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKOR1P84550 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SKOR1P84550 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKOR1P84550 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKOR1P84550 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKOR1P84550 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms