Protein–RNA interactions for Protein: P82930

MRPS34, 28S ribosomal protein S34, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS34P82930 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS34P82930 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS34P82930 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS34P82930 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS34P82930 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS34P82930 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS34P82930 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS34P82930 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS34P82930 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS34P82930 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS34P82930 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms