Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS11P82912 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS11P82912 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPS11P82912 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS11P82912 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS11P82912 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS11P82912 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms