Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2P78314 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2P78314 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2P78314 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2P78314 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2P78314 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH3BP2P78314 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2P78314 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2P78314 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2P78314 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH3BP2P78314 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2P78314 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2P78314 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms