Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS3AP61247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS3AP61247 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS3AP61247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS3AP61247 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS3AP61247 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS3AP61247 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms