Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2BFSP57053 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2BFSP57053 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2BFSP57053 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2BFSP57053 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2BFSP57053 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2BFSP57053 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms