Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CLTCL1P53675 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CLTCL1P53675 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CLTCL1P53675 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLTCL1P53675 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CLTCL1P53675 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CLTCL1P53675 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CLTCL1P53675 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CLTCL1P53675 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CLTCL1P53675 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CLTCL1P53675 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CLTCL1P53675 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CLTCL1P53675 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CLTCL1P53675 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLTCL1P53675 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLTCL1P53675 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLTCL1P53675 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CLTCL1P53675 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms