Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP98P52948 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP98P52948 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP98P52948 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP98P52948 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP98P52948 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP98P52948 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP98P52948 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP98P52948 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP98P52948 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP98P52948 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP98P52948 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP98P52948 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP98P52948 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP98P52948 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP98P52948 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP98P52948 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP98P52948 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP98P52948 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP98P52948 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP98P52948 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP98P52948 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP98P52948 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP98P52948 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP98P52948 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP98P52948 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP98P52948 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP98P52948 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP98P52948 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP98P52948 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP98P52948 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP98P52948 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP98P52948 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP98P52948 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP98P52948 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP98P52948 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP98P52948 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP98P52948 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP98P52948 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUP98P52948 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUP98P52948 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUP98P52948 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUP98P52948 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUP98P52948 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUP98P52948 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP98P52948 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP98P52948 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUP98P52948 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NUP98P52948 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUP98P52948 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUP98P52948 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUP98P52948 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUP98P52948 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUP98P52948 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NUP98P52948 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUP98P52948 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUP98P52948 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUP98P52948 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUP98P52948 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUP98P52948 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUP98P52948 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP98P52948 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP98P52948 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP98P52948 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP98P52948 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP98P52948 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP98P52948 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP98P52948 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP98P52948 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP98P52948 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP98P52948 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP98P52948 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP98P52948 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP98P52948 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP98P52948 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP98P52948 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP98P52948 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP98P52948 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP98P52948 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP98P52948 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP98P52948 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP98P52948 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP98P52948 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP98P52948 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP98P52948 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP98P52948 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP98P52948 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP98P52948 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP98P52948 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP98P52948 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP98P52948 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP98P52948 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP98P52948 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP98P52948 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP98P52948 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.4 ms