Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT3P49368 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT3P49368 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT3P49368 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT3P49368 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT3P49368 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT3P49368 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT3P49368 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT3P49368 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT3P49368 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT3P49368 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT3P49368 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT3P49368 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT3P49368 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT3P49368 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT3P49368 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT3P49368 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT3P49368 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT3P49368 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT3P49368 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT3P49368 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT3P49368 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT3P49368 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT3P49368 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT3P49368 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT3P49368 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT3P49368 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT3P49368 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT3P49368 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT3P49368 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT3P49368 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT3P49368 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT3P49368 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT3P49368 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT3P49368 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT3P49368 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT3P49368 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT3P49368 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT3P49368 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT3P49368 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT3P49368 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT3P49368 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT3P49368 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT3P49368 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT3P49368 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT3P49368 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT3P49368 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT3P49368 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT3P49368 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT3P49368 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT3P49368 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT3P49368 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT3P49368 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT3P49368 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT3P49368 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT3P49368 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT3P49368 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT3P49368 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT3P49368 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT3P49368 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT3P49368 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT3P49368 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT3P49368 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT3P49368 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT3P49368 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT3P49368 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT3P49368 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT3P49368 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT3P49368 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT3P49368 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT3P49368 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT3P49368 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT3P49368 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT3P49368 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT3P49368 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT3P49368 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT3P49368 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT3P49368 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT3P49368 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT3P49368 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT3P49368 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT3P49368 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT3P49368 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT3P49368 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT3P49368 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT3P49368 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT3P49368 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT3P49368 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT3P49368 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT3P49368 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT3P49368 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT3P49368 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT3P49368 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT3P49368 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT3P49368 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT3P49368 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT3P49368 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT3P49368 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT3P49368 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT3P49368 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms