Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD97P48960 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CD97P48960 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD97P48960 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD97P48960 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CD97P48960 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD97P48960 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD97P48960 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD97P48960 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD97P48960 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD97P48960 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD97P48960 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD97P48960 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD97P48960 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD97P48960 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD97P48960 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD97P48960 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD97P48960 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD97P48960 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD97P48960 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD97P48960 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD97P48960 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD97P48960 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD97P48960 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CD97P48960 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD97P48960 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD97P48960 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD97P48960 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD97P48960 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD97P48960 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD97P48960 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD97P48960 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD97P48960 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD97P48960 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD97P48960 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD97P48960 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD97P48960 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD97P48960 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD97P48960 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CD97P48960 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD97P48960 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD97P48960 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD97P48960 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD97P48960 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD97P48960 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD97P48960 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD97P48960 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD97P48960 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD97P48960 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD97P48960 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD97P48960 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CD97P48960 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD97P48960 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD97P48960 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD97P48960 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD97P48960 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD97P48960 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD97P48960 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD97P48960 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD97P48960 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD97P48960 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD97P48960 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD97P48960 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD97P48960 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD97P48960 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD97P48960 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD97P48960 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD97P48960 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD97P48960 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD97P48960 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD97P48960 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD97P48960 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CD97P48960 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD97P48960 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD97P48960 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD97P48960 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD97P48960 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD97P48960 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD97P48960 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD97P48960 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD97P48960 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD97P48960 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD97P48960 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD97P48960 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD97P48960 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD97P48960 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD97P48960 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD97P48960 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD97P48960 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD97P48960 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD97P48960 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD97P48960 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD97P48960 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD97P48960 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD97P48960 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms