Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASRP41180 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASRP41180 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASRP41180 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASRP41180 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASRP41180 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASRP41180 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASRP41180 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASRP41180 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASRP41180 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASRP41180 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASRP41180 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASRP41180 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASRP41180 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASRP41180 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASRP41180 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASRP41180 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASRP41180 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASRP41180 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASRP41180 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASRP41180 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASRP41180 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASRP41180 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASRP41180 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASRP41180 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASRP41180 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASRP41180 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASRP41180 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASRP41180 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASRP41180 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASRP41180 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASRP41180 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASRP41180 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASRP41180 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASRP41180 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASRP41180 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASRP41180 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASRP41180 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASRP41180 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASRP41180 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASRP41180 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms