Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASRP41180 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASRP41180 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASRP41180 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASRP41180 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASRP41180 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASRP41180 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASRP41180 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASRP41180 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASRP41180 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASRP41180 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASRP41180 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASRP41180 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASRP41180 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASRP41180 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASRP41180 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASRP41180 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASRP41180 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASRP41180 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASRP41180 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASRP41180 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASRP41180 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASRP41180 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASRP41180 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASRP41180 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASRP41180 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASRP41180 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASRP41180 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASRP41180 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASRP41180 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASRP41180 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASRP41180 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASRP41180 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASRP41180 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASRP41180 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASRP41180 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASRP41180 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASRP41180 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASRP41180 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASRP41180 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASRP41180 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASRP41180 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASRP41180 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASRP41180 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASRP41180 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASRP41180 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASRP41180 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASRP41180 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASRP41180 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASRP41180 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASRP41180 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASRP41180 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASRP41180 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASRP41180 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASRP41180 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASRP41180 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASRP41180 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms