Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGCXP38435 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGCXP38435 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGCXP38435 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGCXP38435 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GGCXP38435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGCXP38435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGCXP38435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGCXP38435 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGCXP38435 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGCXP38435 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGCXP38435 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGCXP38435 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GGCXP38435 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGCXP38435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGCXP38435 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGCXP38435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGCXP38435 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGCXP38435 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGCXP38435 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGCXP38435 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGCXP38435 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGCXP38435 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGCXP38435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGCXP38435 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGCXP38435 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGCXP38435 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGCXP38435 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGCXP38435 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGCXP38435 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGCXP38435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GGCXP38435 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGCXP38435 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GGCXP38435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGCXP38435 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGCXP38435 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGCXP38435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGCXP38435 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGCXP38435 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGCXP38435 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGCXP38435 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGCXP38435 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGCXP38435 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGCXP38435 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGCXP38435 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GGCXP38435 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGCXP38435 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGCXP38435 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
GGCXP38435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGCXP38435 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGCXP38435 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGCXP38435 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGCXP38435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGCXP38435 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGCXP38435 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGCXP38435 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGCXP38435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGCXP38435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGCXP38435 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGCXP38435 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGCXP38435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GGCXP38435 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGCXP38435 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGCXP38435 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGCXP38435 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGCXP38435 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGCXP38435 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGCXP38435 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGCXP38435 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GGCXP38435 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGCXP38435 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GGCXP38435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGCXP38435 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGCXP38435 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGCXP38435 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GGCXP38435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGCXP38435 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGCXP38435 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGCXP38435 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGCXP38435 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGCXP38435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGCXP38435 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGCXP38435 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GGCXP38435 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGCXP38435 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGCXP38435 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGCXP38435 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGCXP38435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGCXP38435 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GGCXP38435 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGCXP38435 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGCXP38435 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGCXP38435 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGCXP38435 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGCXP38435 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms