Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSP1P33241 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSP1P33241 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSP1P33241 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSP1P33241 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSP1P33241 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSP1P33241 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSP1P33241 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSP1P33241 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSP1P33241 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSP1P33241 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSP1P33241 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSP1P33241 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSP1P33241 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSP1P33241 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSP1P33241 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSP1P33241 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSP1P33241 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSP1P33241 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSP1P33241 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSP1P33241 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSP1P33241 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSP1P33241 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSP1P33241 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSP1P33241 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LSP1P33241 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSP1P33241 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LSP1P33241 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LSP1P33241 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LSP1P33241 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LSP1P33241 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSP1P33241 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LSP1P33241 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LSP1P33241 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LSP1P33241 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSP1P33241 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LSP1P33241 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LSP1P33241 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LSP1P33241 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSP1P33241 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSP1P33241 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSP1P33241 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSP1P33241 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LSP1P33241 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LSP1P33241 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LSP1P33241 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LSP1P33241 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LSP1P33241 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LSP1P33241 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LSP1P33241 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSP1P33241 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSP1P33241 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LSP1P33241 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LSP1P33241 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LSP1P33241 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LSP1P33241 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LSP1P33241 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LSP1P33241 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LSP1P33241 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LSP1P33241 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSP1P33241 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSP1P33241 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSP1P33241 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSP1P33241 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LSP1P33241 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSP1P33241 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSP1P33241 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSP1P33241 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSP1P33241 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSP1P33241 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSP1P33241 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSP1P33241 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSP1P33241 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSP1P33241 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSP1P33241 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSP1P33241 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSP1P33241 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSP1P33241 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
LSP1P33241 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSP1P33241 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSP1P33241 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSP1P33241 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSP1P33241 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSP1P33241 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSP1P33241 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSP1P33241 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSP1P33241 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSP1P33241 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSP1P33241 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSP1P33241 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSP1P33241 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSP1P33241 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSP1P33241 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LSP1P33241 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LSP1P33241 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSP1P33241 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSP1P33241 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSP1P33241 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSP1P33241 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSP1P33241 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms