Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-FP30511 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-FP30511 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-FP30511 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-FP30511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-FP30511 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-FP30511 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-FP30511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-FP30511 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HLA-FP30511 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-FP30511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-FP30511 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-FP30511 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-FP30511 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-FP30511 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-FP30511 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-FP30511 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-FP30511 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-FP30511 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-FP30511 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-FP30511 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-FP30511 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-FP30511 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-FP30511 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-FP30511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms