Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDX3P30048 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDX3P30048 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDX3P30048 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDX3P30048 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDX3P30048 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDX3P30048 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDX3P30048 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDX3P30048 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDX3P30048 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDX3P30048 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX3P30048 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms