Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3P25205 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3P25205 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3P25205 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3P25205 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM3P25205 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3P25205 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM3P25205 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3P25205 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3P25205 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3P25205 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3P25205 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3P25205 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM3P25205 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM3P25205 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3P25205 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM3P25205 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3P25205 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3P25205 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3P25205 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3P25205 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3P25205 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3P25205 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3P25205 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3P25205 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3P25205 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCM3P25205 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM3P25205 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM3P25205 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM3P25205 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM3P25205 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3P25205 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3P25205 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3P25205 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM3P25205 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM3P25205 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM3P25205 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM3P25205 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM3P25205 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM3P25205 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM3P25205 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM3P25205 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3P25205 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3P25205 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3P25205 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3P25205 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3P25205 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3P25205 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3P25205 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3P25205 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3P25205 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM3P25205 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCM3P25205 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM3P25205 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3P25205 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3P25205 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3P25205 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3P25205 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3P25205 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3P25205 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3P25205 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3P25205 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCM3P25205 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM3P25205 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM3P25205 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3P25205 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3P25205 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3P25205 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3P25205 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3P25205 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3P25205 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3P25205 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3P25205 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3P25205 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3P25205 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3P25205 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3P25205 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM3P25205 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3P25205 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3P25205 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3P25205 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3P25205 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3P25205 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MCM3P25205 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM3P25205 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM3P25205 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3P25205 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3P25205 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3P25205 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3P25205 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3P25205 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3P25205 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3P25205 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3P25205 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3P25205 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms