Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCNE1P24864 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNE1P24864 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNE1P24864 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNE1P24864 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCNE1P24864 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCNE1P24864 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCNE1P24864 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNE1P24864 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms