Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RFX1P22670 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX1P22670 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX1P22670 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX1P22670 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX1P22670 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX1P22670 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RFX1P22670 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFX1P22670 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFX1P22670 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFX1P22670 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFX1P22670 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RFX1P22670 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RFX1P22670 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RFX1P22670 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RFX1P22670 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RFX1P22670 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFX1P22670 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RFX1P22670 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFX1P22670 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFX1P22670 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFX1P22670 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFX1P22670 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFX1P22670 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RFX1P22670 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RFX1P22670 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RFX1P22670 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RFX1P22670 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RFX1P22670 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RFX1P22670 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RFX1P22670 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RFX1P22670 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RFX1P22670 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RFX1P22670 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RFX1P22670 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFX1P22670 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFX1P22670 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFX1P22670 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RFX1P22670 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RFX1P22670 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFX1P22670 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RFX1P22670 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RFX1P22670 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFX1P22670 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFX1P22670 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFX1P22670 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX1P22670 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX1P22670 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX1P22670 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX1P22670 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFX1P22670 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX1P22670 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX1P22670 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX1P22670 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RFX1P22670 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RFX1P22670 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX1P22670 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX1P22670 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX1P22670 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX1P22670 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX1P22670 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX1P22670 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFX1P22670 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX1P22670 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX1P22670 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX1P22670 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX1P22670 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX1P22670 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX1P22670 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX1P22670 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX1P22670 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX1P22670 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX1P22670 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX1P22670 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX1P22670 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX1P22670 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX1P22670 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX1P22670 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX1P22670 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX1P22670 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX1P22670 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX1P22670 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX1P22670 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX1P22670 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX1P22670 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX1P22670 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX1P22670 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX1P22670 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX1P22670 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX1P22670 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX1P22670 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX1P22670 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX1P22670 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX1P22670 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX1P22670 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX1P22670 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX1P22670 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX1P22670 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX1P22670 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX1P22670 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms