Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB6P17509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB6P17509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB6P17509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB6P17509 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB6P17509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB6P17509 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB6P17509 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms