Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2A2P16615 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2A2P16615 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2A2P16615 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2A2P16615 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2A2P16615 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP2A2P16615 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2A2P16615 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2A2P16615 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2A2P16615 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A2P16615 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms