Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX1P15863 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX1P15863 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX1P15863 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX1P15863 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX1P15863 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX1P15863 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX1P15863 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX1P15863 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX1P15863 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX1P15863 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX1P15863 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX1P15863 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX1P15863 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX1P15863 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX1P15863 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX1P15863 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX1P15863 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX1P15863 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX1P15863 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX1P15863 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX1P15863 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX1P15863 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX1P15863 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX1P15863 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX1P15863 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX1P15863 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX1P15863 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX1P15863 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX1P15863 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX1P15863 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX1P15863 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX1P15863 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX1P15863 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX1P15863 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX1P15863 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX1P15863 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX1P15863 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX1P15863 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAX1P15863 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAX1P15863 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAX1P15863 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX1P15863 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX1P15863 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX1P15863 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAX1P15863 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX1P15863 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX1P15863 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX1P15863 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX1P15863 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX1P15863 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX1P15863 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX1P15863 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX1P15863 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX1P15863 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX1P15863 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX1P15863 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX1P15863 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX1P15863 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX1P15863 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX1P15863 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX1P15863 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX1P15863 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX1P15863 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX1P15863 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX1P15863 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX1P15863 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX1P15863 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX1P15863 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX1P15863 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX1P15863 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX1P15863 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAX1P15863 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX1P15863 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX1P15863 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX1P15863 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX1P15863 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX1P15863 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX1P15863 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX1P15863 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX1P15863 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX1P15863 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX1P15863 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms