Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP4P12644 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BMP4P12644 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP4P12644 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMP4P12644 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BMP4P12644 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP4P12644 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BMP4P12644 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BMP4P12644 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP4P12644 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP4P12644 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BMP4P12644 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP4P12644 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BMP4P12644 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP4P12644 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP4P12644 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP4P12644 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP4P12644 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BMP4P12644 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMP4P12644 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP4P12644 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP4P12644 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMP4P12644 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP4P12644 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP4P12644 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP4P12644 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP4P12644 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP4P12644 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP4P12644 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP4P12644 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP4P12644 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP4P12644 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP4P12644 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP4P12644 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP4P12644 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP4P12644 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BMP4P12644 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP4P12644 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP4P12644 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP4P12644 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP4P12644 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP4P12644 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP4P12644 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP4P12644 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP4P12644 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP4P12644 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP4P12644 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP4P12644 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP4P12644 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP4P12644 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP4P12644 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP4P12644 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP4P12644 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP4P12644 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BMP4P12644 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BMP4P12644 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BMP4P12644 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP4P12644 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP4P12644 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP4P12644 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP4P12644 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP4P12644 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP4P12644 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP4P12644 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP4P12644 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP4P12644 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP4P12644 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP4P12644 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP4P12644 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP4P12644 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP4P12644 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP4P12644 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP4P12644 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP4P12644 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP4P12644 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP4P12644 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP4P12644 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP4P12644 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP4P12644 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP4P12644 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP4P12644 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP4P12644 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP4P12644 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP4P12644 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP4P12644 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP4P12644 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP4P12644 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP4P12644 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP4P12644 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP4P12644 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP4P12644 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP4P12644 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP4P12644 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP4P12644 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP4P12644 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP4P12644 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP4P12644 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP4P12644 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BMP4P12644 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP4P12644 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms