Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPIPA8P0DM63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPIPA8P0DM63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPIPA8P0DM63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPIPA8P0DM63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPA8P0DM63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA8P0DM63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPIPA8P0DM63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPA8P0DM63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms