Protein–RNA interactions for Protein: P0CL84

STAG3L2, Putative STAG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L2P0CL84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L2P0CL84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L2P0CL84 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STAG3L2P0CL84 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAG3L2P0CL84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAG3L2P0CL84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAG3L2P0CL84 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAG3L2P0CL84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STAG3L2P0CL84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STAG3L2P0CL84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms