Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1P09603 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF1P09603 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF1P09603 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1P09603 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1P09603 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1P09603 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1P09603 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1P09603 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1P09603 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1P09603 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1P09603 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1P09603 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1P09603 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1P09603 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1P09603 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1P09603 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1P09603 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1P09603 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1P09603 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1P09603 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1P09603 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1P09603 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF1P09603 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF1P09603 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF1P09603 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF1P09603 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF1P09603 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF1P09603 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF1P09603 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF1P09603 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF1P09603 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF1P09603 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF1P09603 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF1P09603 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF1P09603 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF1P09603 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF1P09603 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF1P09603 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF1P09603 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF1P09603 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF1P09603 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1P09603 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1P09603 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1P09603 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1P09603 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1P09603 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1P09603 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1P09603 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1P09603 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1P09603 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1P09603 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1P09603 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1P09603 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1P09603 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1P09603 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1P09603 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1P09603 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1P09603 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1P09603 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1P09603 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1P09603 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1P09603 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1P09603 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1P09603 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1P09603 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1P09603 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1P09603 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1P09603 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1P09603 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1P09603 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1P09603 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1P09603 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1P09603 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1P09603 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1P09603 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1P09603 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1P09603 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1P09603 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1P09603 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1P09603 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1P09603 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1P09603 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1P09603 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1P09603 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1P09603 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1P09603 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1P09603 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1P09603 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1P09603 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1P09603 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1P09603 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1P09603 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1P09603 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms