Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCP09486 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCP09486 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCP09486 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCP09486 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCP09486 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCP09486 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCP09486 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCP09486 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCP09486 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCP09486 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCP09486 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCP09486 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCP09486 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCP09486 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCP09486 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCP09486 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCP09486 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCP09486 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCP09486 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCP09486 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCP09486 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCP09486 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCP09486 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCP09486 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPARCP09486 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPARCP09486 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCP09486 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCP09486 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCP09486 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCP09486 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPARCP09486 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCP09486 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCP09486 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPARCP09486 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCP09486 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCP09486 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCP09486 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCP09486 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCP09486 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCP09486 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCP09486 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCP09486 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPARCP09486 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPARCP09486 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCP09486 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCP09486 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCP09486 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCP09486 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCP09486 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCP09486 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCP09486 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCP09486 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPARCP09486 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPARCP09486 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPARCP09486 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPARCP09486 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPARCP09486 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPARCP09486 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPARCP09486 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPARCP09486 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPARCP09486 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPARCP09486 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPARCP09486 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPARCP09486 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPARCP09486 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPARCP09486 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPARCP09486 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPARCP09486 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPARCP09486 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPARCP09486 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPARCP09486 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPARCP09486 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPARCP09486 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPARCP09486 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPARCP09486 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPARCP09486 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPARCP09486 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPARCP09486 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPARCP09486 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPARCP09486 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPARCP09486 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPARCP09486 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPARCP09486 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPARCP09486 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPARCP09486 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPARCP09486 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPARCP09486 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPARCP09486 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPARCP09486 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms