Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCKP06239 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCKP06239 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCKP06239 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCKP06239 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCKP06239 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCKP06239 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCKP06239 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCKP06239 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCKP06239 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCKP06239 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCKP06239 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCKP06239 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCKP06239 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCKP06239 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCKP06239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCKP06239 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCKP06239 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCKP06239 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCKP06239 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCKP06239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCKP06239 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCKP06239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCKP06239 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCKP06239 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCKP06239 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCKP06239 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCKP06239 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCKP06239 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCKP06239 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCKP06239 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCKP06239 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCKP06239 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCKP06239 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCKP06239 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCKP06239 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCKP06239 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCKP06239 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCKP06239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCKP06239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCKP06239 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LCKP06239 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCKP06239 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCKP06239 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCKP06239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCKP06239 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCKP06239 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCKP06239 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCKP06239 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCKP06239 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCKP06239 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCKP06239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCKP06239 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCKP06239 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCKP06239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCKP06239 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCKP06239 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCKP06239 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCKP06239 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LCKP06239 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCKP06239 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCKP06239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCKP06239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCKP06239 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCKP06239 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCKP06239 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCKP06239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCKP06239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCKP06239 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCKP06239 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCKP06239 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCKP06239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCKP06239 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCKP06239 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCKP06239 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCKP06239 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCKP06239 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCKP06239 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCKP06239 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCKP06239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCKP06239 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCKP06239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCKP06239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCKP06239 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCKP06239 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCKP06239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCKP06239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCKP06239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCKP06239 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms