Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR3DP05423 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
POLR3DP05423 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLR3DP05423 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR3DP05423 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR3DP05423 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
POLR3DP05423 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR3DP05423 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3DP05423 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms